Arxiu Europeu de Nucleòtids
| URL | http://www.ebi.ac.uk/ena  |
|---|---|
| Tipus | base de dades biològica |
| Llicència | llicència de propietat |
| Part de | ELIXIR EMBL-EBI Node (en)  |
| Mantenidor | European Bioinformatics Institute i European Molecular Biology Laboratory |
| Llançament | octubre 1980 |
| |
L'Arxiu Europeu de Nucleòtids (European Nucleotide Archive, ENA) és un dipòsit que proporciona accés gratuït i sense restriccions a seqüències anotades d'ADN i ARN. A més, emmagatzema informació complementària, com ara procediments experimentals, detalls del muntatge de seqüències i altres dades relacionades amb projectes de seqüenciació.[1]
L’ENA va ser creat i és mantingut per l'Institut Europeu de Bioinformàtica i és membre de la International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC) juntament amb el DNA DataBank del Japó (DDBJ) i GenBank.[1] ENA es va establir a principis dels anys vuitanta com a EMBL Data Library (més tard rebatejada com EMBL Nucleotide Sequence Database, EMBL-Bank) i es va centrar inicialment en seqüències de nucleòtids altament anotades.[2]
L'arxiu consisteix en nivells d’anotació ENA, ensamblatge ENA i ENA-Reads. A l'octubre de 2009, ENA-Annotation i ENA-Assembly contenien 163 milions de registres que corresponien a 283.000 milions de bases. Les seqüències obtingudes "per perdigonada" (shotgun) de genoma complet continuen sent la font dominant de noves seqüències (un 30% de seqüències i un 53% de bases) seguides de les de marcadors de seqüència expressada (EST) (38% de seqüències i 12% de bases).[1]
Vegeu també
[modifica]Referències
[modifica]- ↑ 1,0 1,1 1,2 Harrison, Peter W; Ahamed, Alisha; Aslam, Raheela; Alako, Blaise T F; Burgin, Josephine «The European Nucleotide Archive in 2020» (en anglès). Nucleic Acids Research, 11-11-2020, pàg. gkaa1028. DOI: 10.1093/nar/gkaa1028. ISSN: 0305-1048.
- ↑ Leinonen, Rasko; Akhtar, Ruth; Birney, Ewan; Bonfield, James; Bower, Lawrence «Improvements to services at the European Nucleotide Archive». Nucleic Acids Research, 38, Database issue, 1-2010, pàg. D39–45. DOI: 10.1093/nar/gkp998. ISSN: 1362-4962. PMC: 2808951. PMID: 19906712.