Mary Onyali de Nigèria guanyà medalles d'or als 100 metres i 200 metres, obtenint les seves tercera i quarta medalles des de 1991. Kutre Dulecha guanyà la seva tercera medalla consecutiva en els 1500 metres. Nigèria guanyà les dues curses de relleus femenines.
El campionat de boxa dels Jocs Panafricans de 2003 serví de classificació per als Jocs Olímpics d'Estiu de 2004 d'Atenes. Un total de 182 lluitadors de 27 països hi prengueren part. Nigèria (4 ors, 3 plates, cap bronze) encapçalà el medaller dseguida d'Egipte (3 ors, 2 plates, 2 bronzes) i Algèria (2 ors, 1 plata, 4 bronzes). Tots els finalistes assoliren plaça per als Jocs. Dos altres rondes classificatòries es disputaren més tard a Casablanca, Marroc (gener, 2004) i Gaborone, Botswana (març, 2004).
La competició de futbol fou guanyada pel Camerun, esdevenint la primera selecció a guanyar tres cops aquest torneig. També fou introduïda la competició femenina, que fou guanyada per Nigèria.