Vés al contingut

BankIt

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure

BankIt és una eina d'enviament de seqüències basada en web.[1] S'utilitza per enviar dades de seqüències a GenBank. Serveix per a enviar:[2]

  • Una sola seqüència
  • Unes quantes seqüències no relacionades o unes quantes seqüències amb diferent informció font i característiques
  • Un petit lot de seqüències amb un nombre reduït de funcions o informació font
  • Un gran conjunt de seqüències amb un nombre reduït de les mateixes característiques / informació font

Informació requerida

[modifica]

Per completar l'enviament d'una seqüència BankIt, el programa demanarà:[2]

  • Informació de contacte de la persona que realitza l'enviament
  • Els noms dels autors de la seqüència
  • Informació de referència
  • Seqüència de nucleòtids i informació general sobre la seqüència
  • El títol del document previst o publicat que descriu la seqüència
  • Categoria d'enviament. Si va ser creat partir de dades existents o va ser directament seqüenciat.
  • Informació de font. Informació sobre d'on es va aïllar la seqüència.
  • Encebadors de la PCR (opcionals)
  • Informació de funcions. Consisteix en anotar les parts de la seqüència que tenen una funció específica: exó, intró, gen, regió de codificació, ARN funcional, etc. Un cop s'hagi introduït tota la informació d'enviament, es mostrarà l'esborrany del fitxer, el qual podrà ser retocat o modificat amb dades addicionals, i finalment s'enviarà.

Vegeu també

[modifica]

Referències

[modifica]
  1. Fetchko, Michael; Kitts, Adrienne. What is BankIt? (en anglès). National Center for Biotechnology Information (US), 2011. 
  2. 2,0 2,1 «About BankIt Submission». [Consulta: 19 desembre 2020].

Enllaços externs

[modifica]