El Cork Hibernians va ser fundat l'any 1957. S'uní a la lliga irlandesa després de l'expulsió d'un altre club de la ciutat, el Cork Athletic F.C.. El club ja existia abans de ser membre de la lliga amb el nom de AOH (Ancient Order of Hibernians). Era un club estrictament amateur, cosa que li impedia ser escollit per a la màxima competició del país, però finalment fou encoratjat per crear un club professional, i com a resultat nasqué el Cork Hibernians Football Club.
Cork Hibernians tenia la seu a Flower Lodge i durant molts anys mantingué forta rivalitat amb l'altre equip de la ciutat, el Evergreen United F.C./Cork Celtic F.C.. El club desaparegué el 1977 a causa de problemes econòmics, essent reemplaçat per l'Albert Rovers F.C., de la mateixa ciutat.