Isopropil β-D-1-tiogalactopiranòsid
| Substància química | tipus d'entitat química  |
|---|---|
| Massa molecular | 238,087 Da |
| Estructura química | |
| Fórmula química | C₉H₁₈O₅S |
 | |
| SMILES canònic | |
| SMILES isomèric | CC(C)S[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O1)CO)O)O)O
|
| Identificador InChI | Model 3D |
| Propietat | |
| Punt de fusió | 112 °C |
L'isopropil β-D-1-tiogalactopiranòsid (IPTG) és un reactiu usat en biologia molecular. Aquest compost sintètic que imita part de l'estructura química de l'al·lolactosa, un metabòlit de la lactosa que activa la transcripció de l'operó lac, i és per això que s'utilitza per induir l'expressió proteica quan un gen es troba sota el control de l'operador lac.
L'IPTG, a diferència de l'al·lolactosa, no és hidrolitzat degut a l'acció de la β-galactosidasa. Per tant, la seva concentració resta constant durant un experiment. Típicament, per causar la inducció, una solució estèril i filtrada de concentració 1 M d'IPTG és afegida amb una dilució 1:1000 al cultiu bacterià en fase de creixement logarítmic, obtenint una concentració final d'1 mM. Tanmateix, també es poden utilitzar diferents concentracions d'IPTG, normalment en el rang de 0,1 a 1 mM.[1]
Mecanisme d'acció
[modifica]Com l'al·lolactose, l'IPTG s'uneix al repressor lac tetramèric i l'allibera de l'operador lac amb una cinètica al·lostèrica, permetent així la transcripció dels gens de l'operó lac, entre ells el gen que codifica la β-galactosidasa, un enzim que catalitza la hidròlisi de β-galactòsids a monosacàrids. Però a diferència de l'al·lolactosa, l'àtom de sofre (S) present en l'IPTG forma un enllaç químic que no és hidrolitzable, impedint la metabolització o degradació de l'inductor. Per tant la concentració d'IPTG resta constant i l'expressió dels gens que es troben sota el control de l'operador lac no són inhibits durant l'experiment.
La captació d'IPTG per part de l'E. coli pot ser independent de l'acció de la lactosa permeasa, perquè és transportat a l'interior de la cél·lula mitjançant una altra ruta.[2] A baixes concentracions, l'IPTG entra a les cèl·lules a través de la lactosa permeasa, però a concentracions altes (típicament les utilitzat per induir l'expressió de proteïna), l'IPTG pot entrar a les cèl·lules independentment de l'acció de la lactosa permeasa.[3]
Ús al laboratori
[modifica]L'IPTG és un inductor eficaç d'expressió proteica en la gamma de concentració de 100 μM a 1,0 mM.[1] La concentració utilitzada depèn del grau d'inducció requerit, així com del genotip de cèl·lules o plasmidi utilitzat. Si el gen lacIq, un mutant que sobreprodueix el repressor lac, és present, llavors una concentració més alta d'IPTG pot ser necessària.[4]
En experiments de clonació molecular, les colònies bacterianes que han estat transformades amb un plasmidi recombinant es poden identificar usant un anàleg de la galactosa, el 5-brom-4-clor-3-indolil-β-D-galactopiranòsid (X-gal). Aquest compost pot ser metabolitzat per la β-galactosidasa en galactosa, un monosacàrid, i 5-brom-4-clor-3-hidroxindol, un compost de color blau. Les cèl·lules transformants que han captat els plasmidis amb l'operó lac intacte, quan són induïdes amb IPTG, expressen activament β-galactosidasa, que hidrolitza X-gal i tinta de blau les colònies. Les colònies de cèl·lules transformants que han captat un plasmidi amb l'operó lac recombinant, en el qual ha estat inserit el gen d'una proteïna d'interès, pateixen amb la inserció del nou gen la inactivació del gen lacZ (un dels gens que codifica la β-galactosidasa) i per tant, no poden expressar β-galactosidasa ni degradar X-gal, romanent les colònies de color blanc.[5]
Altres Noms
[modifica]Isopropil 1-thio-b-D-galactopiranòsid
Isopropil 1-Thio-β-D-galactopiranòsid
Isopropil β-D-thiogalactopiranòsid
Isopropil-b-D-thiogalactopiranòsid
Isopropil-β-D-thiogalactopiranòsid
1-(Isopropiltio)-β-Galactopiranòsid
D-β-isopropiltiogalactiòsid
Propan-2-il 1-tio-β-D-galactopiranòsid
β-D-Galactopiranòsid 1-metiletil 1-tio-
(2S,4S,3R,5R,6R)-6-(hidroximetil)-2-(metiletiltio)-2H-3,4,5,6-tetrahidropiran-3,4,5-triol
[6]
Referències
[modifica]- ↑ 1,0 1,1 «Bujard et al.» p. 1208, 1997.
- ↑ Hansen LH, Knudsen S, Sørensen SJ «The effect of the lacY gene on the induction of IPTG inducible promoters, studied in Escherichia coli and Pseudomonas fluorescens». Curr. Microbiol., 36, 6, 6-1998, pàg. 341–7. DOI: 10.1007/s002849900320. PMID: 9608745.
- ↑ Marbach A, Bettenbrock K. «lac operon induction in Escherichia coli: Systematic comparison of IPTG and TMG induction and influence of the transacetylase LacA». Journal of Biotechnology, 157, 1, 2012, pàg. 82–8. DOI: 10.1016/j.jbiotec.2011.10.009. PMID: 22079752.
- ↑ BL21(DE3) Competent Cells, BL21 (DE3)pLysS Competent Cells, and BL21 Competent Cells Instruction Manual. Revision #066004e. La Jolla, CA: Stratagene, 2006, p. 7.
- ↑ Sambrook, Joseph; Russell, David. Molecular Cloning - A Laboratory Manual. 3rd, p. 1.27. ISBN 978-0-87969-577-4.
- ↑ http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.571154.html
Enllaços externs
[modifica]- Descripció de l'IPTG al web Acros[1] (anglès)
- IPTG enllaçat a proteïnes al PDB (anglès)