Magnus Manske
Biografia | |
---|---|
Naixement | (de) Heinrich Magnus Manske 24 maig 1974 (50 anys) Colònia (Alemanya Occidental) |
Formació | Universitat de Colònia - bioquímica (2003–2006) Hölderlin Gymnasium (en) (1984–1993) |
Director de tesi | Helmut W. Klein (en) |
Activitat | |
Camp de treball | Seqüenciació d'ADN, visualització de dades i malària |
Ocupació | desenvolupador de programari, informàtic, viquimedista, bioinformàtic, bioquímic, biòleg |
Ocupador | Wellcome Sanger Institute (en) (2007–) |
Obra | |
Obres destacables
| |
Premis | |
| |
Lloc web | magnusmanske.de |
cap valor |
Heinrich Magnus Manske (nascut el 24 de maig de 1974 a Colònia, Alemanya) és un científic sènior al Wellcome Trust Sanger Institute de Cambridge, Regne Unit, i un desenvolupador de programari que va crear una de les primeres versions del programari MediaWiki.[1][2][3]
Educació
[modifica]Va estudiar bioquímica a la Universitat de Colònia i es va doctorar l'any 2006. La seva tesi era sobre una eina de programari lliure per a la biologia molecular anomenada GENtle.[4][5]
Carrera
[modifica]Mentre estudiava va ser un dels primers col·laboradors a l'enciclopèdia en línia Nupedia, precursora de la Viquipèdia, i més tard va crear una de les primeres versions del programari MediaWiki que és la base de la Viquipèdia.[6] Manske treballa dins @Cambridge amb el Wellcome Trust Sanger Institute de Cambridge des de l'abril de 2007, però segueix participant d'eines per a la Viquipèdia i Wikidata.[7][8][9][10][11][12]
L'any 2012, va ser coautor d'un document publicat a Nature que demostrava noves formes d'identificar àrees on es desenvolupa el paràsit de la malària i descrivia tècniques per crear mapes amb la resistència a la medicina contra la malària. Els investigadors van desenvolupar una tècnica per a extraure l'ADN del paràsit de la malària directament de la sang, fet que minimitza els errors de seqüenciació.[7][13]
Desenvolupament de MediaWiki
[modifica]Durant la seva etapa educativa era un dels col·laboradors més actius al projecte Nupedia, lliurant contingut sobre biologia i desenvolupant eines i complements per Nupedia.[14][6][15] Més endavant, l'any 2002, molest per les limitacions del programari, va desenvolupar una de les primeres versions del que després havia de ser MediaWiki.[14][15][16][14]
El programari wiki utilitzat inicialment per la Viquipèdia s'anomenava UseModWiki i estava escrit en Perl. Quan la Viquipèdia va començar a créixer i varen aparèixer els primers problemes d'escalat, l'estiu de 2001, en Manske va començar a treballar en l'eina que substituiria al UseModWiki, que utilitzaria una base de dades i que tindria prestacions específiques per la wikipedia.[17] El 25 de gener de 2002, va alliberar la primera versió d'un motor wiki en PHP que utilitzava MySQL, anomenat Phase II.[18] Una de les innovacions implementades per Manske a Phase II va ser l'ús d'espais de noms a fi de separar diferents tipus de pàgines, com la de "Discussió" o "Usuari", el qual destacava respecte a l'anterior programari wiki, que no tenia diferents espais de noms.[17] Phase II també va introduir altres característiques que encara s'utilitzem, com les pujades, llistes de vigilància, signatures automàtiques i llistat de contribució d'usuaris.[19][20] La reescriptura d'en Manske també va facilitar la integració de fotografies als articles de la Viquipèdia i va crear un nou grup d'usuaris: els administradors, amb capacitat per esborrar pàgines i bloca els vàndals.[14][21]
Manske era partidari del programari lliure i més específicament de la llicència GPL, i va publicar el seu treball a les primeres versions del MediaWiki sota aquesta.[22]
Phase II va patir problemes de càrrega a mesura que la Viquipèdia va continuar creixent, així que en Lee Daniel Crocker va crear-ne una altra versió, Phase III, que es va utilitzar des del juny de 2002 i que des de l'any 2003 es va anomenar "MediaWiki".[18] El programari MediaWiki resultant s'utilitza actualment com a plataforma base de la Wikimedia i molts projectes germans, així a moltes organitzacions i institucions.
Manske continua desenvolupant eines i extensions per al MediaWiki, incloent eines per crear categories de membres, computar interseccions de categories i importar imatges des de Flickr al Commons.[23][24] També va desenvolupar l'extensió Cite, que va portar una sintaxi similar a l'XML a la gestió de cites.[25]
Reconeixements
[modifica]És reconegut com el creador del primer article en la Viquipèdia alemanya, el qual és el de la reacció en cadena de la polimerasa, escrit per ell l'any 2001.[26][27][28]
L'any 2002 Jimmy Wales va instaurar el 25 de gener com el dia Magnus Maske, en honor de les seves contribucions a la Viquipèdia, proclamant que «Avui a l'hora de sopar, cada Viquipedista hauria de fer un brindis pel Magnus i totes les seves creacions».[29] Larry Sanger, en les seves memòries sobre els inicis de la Viquipèdia, ressaltava les contribucions que Manske va fer al projecte i atribueix l'èxit de la Viquipèdia a un grup de persones, amb Manske en un lloc important:
« | La Viquipèdia va començar amb un grapat de persones, moltes de Nupedia. La influència dels Nupedians va ser crucial al principi. Penso, especialment, en el incansable Magnus Manske (qui va treballar en el programari per ambdós projectes), el nostre becari insistent, en Ruth Ifcher, i el molt intel·ligent programador i jugador de póker, Lee Daniel Crocker—per anomenar alguns. Així, perquè el projecte va començar amb aquest gran grup de persones, vàrem ser capaços d'adoptar, explicar i promocionar bons hàbits i polítiques a les noves persones. Les arrels de la Nupèdia del projecte van ajudar a desenvolupar una comunitat robusta, funcional i exitosa.[30] | » |
Manske, juntament amb altres, va ser reconegut com un dels majors contribuïdors a MediaWiki per l'associació USENIX Advanced Computing Technical Association, quan MediaWiki i la Fundació Wikimedia varen rebre el premi STUG (Grup d'Usuari d'Eines de Programari).[31]
Referències
[modifica]- ↑ Magnus Manske's publications indexed by the Scopus bibliographic database, a service provided by Elsevier.
- ↑ Daub, J.; Gardner, P. P.; Tate, J.; Ramsköld, D.; Manske, M.; Scott, W. G.; Weinberg, Z.; Griffiths-Jones, S.; Bateman, A. «The RNA WikiProject: Community annotation of RNA families». RNA, 14, 12, 2008, pàg. 2462–2464. DOI: 10.1261/rna.1200508. PMC: 2590952. PMID: 18945806.
- ↑ Magnus Manske a
- ↑ Magnus Manske (2006).
- ↑ Alastair Kerr. «Desktop Sequence Analysis: software review», 21-06-2011. Arxivat de l'original el 27 de juny 2013. [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ 6,0 6,1 Claudia Lehnen «Der Wikipedia-Pionier aus Köln» (en alemany). Kölner Stadt-Anzeiger, 02-02-2008 [Consulta: 22 juny 2013].
- ↑ 7,0 7,1 Manske, M.; Miotto, O.; Campino, S.; Auburn, S.; Almagro-Garcia, J.; Maslen, G.; o’Brien, J.; Djimde, A.; Doumbo, O. «Analysis of Plasmodium falciparum diversity in natural infections by deep sequencing». Nature, 487, 7407, 2012, pàg. 375–9. DOI: 10.1038/nature11174. PMID: 22722859.
- ↑ Manske, H. M.; Kwiatkowski, D. P. «Look Seq: A browser-based viewer for deep sequencing data». Genome Research, 19, 11, 2009, pàg. 2125–32. DOI: 10.1101/gr.093443.109. PMID: 19679872.
- ↑ Manske, H. M.; Kwiatkowski, D. P. «SNP-o-matic». Bioinformatics, 25, 18, 2009, pàg. 2434–5. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp403. PMID: 19574284.
- ↑ Robinson, T.; Campino, S. G.; Auburn, S.; Assefa, S. A.; Polley, S. D.; Manske, M.; MacInnis, B.; Rockett, K. A.; Maslen, G. L. «Drug-Resistant Genotypes and Multi-Clonality in Plasmodium falciparum Analysed by Direct Genome Sequencing from Peripheral Blood of Malaria Patients». PLoS ONE, 6, 8, 2011, pàg. e23204. DOI: 10.1371/journal.pone.0023204. PMC: 3154926. PMID: 21853089.
- ↑ Logan, D. W.; Sandal, M.; Gardner, P. P.; Manske, M.; Bateman, A. «Ten Simple Rules for Editing Wikipedia». PLOS Computational Biology, 6, 9, 2010, pàg. e1000941. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1000941. PMC: 2947980. PMID: 20941386.
- ↑ «Magnus Manske». [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ «DNA Research; Putting parasites on the world map». China Weekly News, 26-06-2012.
- ↑ 14,0 14,1 14,2 14,3 Kurt Jansson «Zehn Jahre Wikipedia – Der kurze Sommer der Anarchie». Der Spiegel, 14-01-2011.
- ↑ 15,0 15,1 Jennifer Joline Anderson. Wikipedia: The Company and Its Founders. ABDO, 2011, p. 44. ISBN 9781617148125.
- ↑ Torsten Kleinz «Neues Werkzeug soll Anfänger zur Wikipedia locken». Die Zeit, 16-12-2012.
- ↑ 17,0 17,1 Sumana Harihareswara; Guillaume Paumier «MediaWiki». A: Amy Brown. The Architecture of Open Source Applications. Kristian Hermansen, 2012. ISBN 9781105571817.
- ↑ 18,0 18,1 Rajeev Kumar «Wiki Installation and Customization». [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ «Wikipedia:PHP script new features», 27-01-2002. [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ Magnus Manske. «[Wikipedia-l New features list]», 27-01-2002. [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ Erik Möller «Das Wiki-Prinzip». Heise online, 09-05-2003.
- ↑ N. A. Polukarova «The concept of open editing from the copyright viewpoint». Automatic Documentation and Mathematical Linguistics. Allerton Press, Inc., 41, 3, 6-2007, pàg. 104–107. DOI: 10.3103/S0005105507030053. ISSN: 1934-8371. «In simpler words, while the developers of proprietary programs use their copyrights to deprive most of the users of most of their freedoms, GPL adherents, including above-mentioned Magnus Manske, use these privileges to guarantee these freedoms to users.»
- ↑ «Magnus' toys'n'tools». [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ «Magnus' tools on wmflabs». [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ (març 2009) "Introducing new features to Wikipedia". Proceedings of the First International Conference on Web Sciences WebSci09 [Consulta: 4 juny 2013] Arxivat 3 de març 2016 a Wayback Machine.
- ↑ «German Wikipedia reaches landmark millionth entry». Deutsche Welle, 28-12-2009.
- ↑ dpa/mos «Deutsche Wikipedia erreicht eine Million Einträge». Die Zeit, 28-12-2009.
- ↑ Achim Sawall «Deutschsprachige Wikipedia erreicht die Millionenmarke». golem.de, 28-12-2009.
- ↑ «[Wikipedia-l Celebration]», 25-01-2002. [Consulta: 4 juny 2013].
- ↑ Larry Sanger. «The Early History of Nupedia and Wikipedia: A Memoir». A: Open Sources 2.0: The Continuing Evolution. O'Reilly Media, 2008, p. 317. ISBN 9780596553890 [Consulta: 23 juny 2013].
- ↑ «STUG award». [Consulta: 4 juny 2013].
Enllaços externs
[modifica]- Robert Zeschke. WikiHooks - Eine protoypenhafte Webhook Extension für MediaWiki, p. 9. ISBN 978-3-640-96452-9.
- Les eines de Wikimedia creades per Manske a Wikimedia Laboratoris
- Perfil de Magnus Manske a Bitbucket, on hostatja la major part del codi que manté
- Entrada Arxivat 2015-02-13 a Wayback Machine. a malariagen.Net