Vés al contingut

Timeless (gen)

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
Infotaula de gen Timeless (gen)
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Identificadors
ÀliesTIMELESS (HUGO), TIM, TIM1, hTIM, timeless circadian clock, timeless circadian regulator
Identif. externsOMIM: 603887   MGI: 1321393   HomoloGene: 31206   GeneCards: TIMELESS   OMA: TIMELESS - orthologs
Malalties relacionades genèticament
verola [1]
Wikidata
Veure/Editar gen humàVeure/Editar gen del ratolí
Estructura de cristall de la forma nativa del domini Timeless_PAB

Timeless (tim) és un gen de múltiples espècies, però destaca pel seu paper a Drosophila per codificar TIM, una proteïna essencial que regula el ritme circadià. L'ARNm i la proteïna atemporals oscil·len rítmicament amb el temps com a part d'un bucle de retroalimentació negativa de transcripció i traducció que implica el gen del període (per) i la seva proteïna.

Descobriment

[modifica]
Una visió general dels gens i proteïnes més importants del rellotge biològic de Drosophila melanogaster. La molècula d'ADN està modificada a partir d'ADN Overview per Michael Ströck, publicat sota GFDL i publicat a Commons. PER=Període, TIM=Timeless, CLK=Clock, CYC=Cycle, VRI=Vrille, PDP1=PAR Domain Protein 1ε, DBT=Doubletime, CRY=Cryptochrome

El 1994, atemporal va ser descobert a través d'un cribratge genètic avançat realitzat per Jeffery L. Price mentre treballava al laboratori de Michael W. Young.[6] Aquest gen es va trobar quan van notar un mutant tim01 arrítmic mitjançant una pantalla d'element P. [7][8] La mutació tim01 va provocar un comportament arrítmic, definit per la manca d'habilitat per establir ritmes circadians adequats.[6] El 1995, el gen atemporal va ser clonat per Amita Sehgal i socis del laboratori de Michael W. Young.[9] A diferència del gen atemporal de Drosophila, s'han descobert homòlegs en altres espècies que no són essencials per al ritme circadià.[10] El descobriment de l'atemporal va seguir el descobriment dels mutants del període el 1971 mitjançant un cribratge genètic avançat, la clonació de per el 1984 i un experiment que va determinar que per és circadià el 1990. Això va passar durant un període de ràpida expansió en el camp de la cronobiologia als anys noranta.

Estructura

[modifica]

La longitud de la regió codificant del gen atemporal de la Drosophila és de 4029 parells de bases, a partir dels quals es transcriu una proteïna de 1398 aminoàcids.[11] El gen comença en un lloc de consens aigües amunt d'un codó de metionina. Conté 11 exons i 10 introns. En diverses espècies de Drosophila, la proteïna atemporal TIM conté dominis funcionals i seqüència d'aminoàcids més altament conservats que la seva contrapart, PER (proteïna codificada per per ). La CLD va ser la menys conservada d'aquestes regions entre D. virilis i D. melanogaster.[11] Aquestes parts conservades inclouen: el domini d'interacció PER, el senyal de localització nuclear (NLS), el domini de localització citoplasmàtica (CLD), l'extrem N-terminal (no funcional) i l'extrem C-terminal.[11] També se sap que TIM té una regió bàsica, que interacciona amb el domini PAS de la proteïna PER, i una regió àcida central. També hi ha una regió de funció desconeguda prop de l'extrem N de la proteïna TIM que conté una seqüència de 32 aminoàcids que, quan s'elimina, provoca un comportament arrítmic a la mosca. En diverses espècies de Drosophila, com ara D. virilis i D. melanogaster, la metionina inicial per a la traducció del gen atemporal a TIM es troba en diferents llocs, amb el lloc d'inici de D. virilis aigües avall del lloc d'inici a D. melanogaster.[11]

Referències

[modifica]
  1. «Malalties que s'associen genèticament amb Timeless (gen), vegeu/editeu les referències a wikidata».
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111602 - Ensembl, May 2017
  3. 3,0 3,1 3,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039994Ensembl, May 2017
  4. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  6. 6,0 6,1 Nature, 417, 6886, 5-2002, pàg. 329–35. Bibcode: 2002Natur.417..329P. DOI: 10.1038/417329a. PMID: 12015613.
  7. Cell, 98, 3, 8-1999, pàg. 365–76. DOI: 10.1016/S0092-8674(00)81965-0. PMID: 10458611 [Consulta: free].
  8. Science, 263, 5153, 3-1994, pàg. 1603–6. Bibcode: 1994Sci...263.1603S. DOI: 10.1126/science.8128246. PMID: 8128246.
  9. Science, 270, 5237, 11-1995, pàg. 805–8. Bibcode: 1995Sci...270..805M. DOI: 10.1126/science.270.5237.805. PMID: 7481771.
  10. Journal of Insect Physiology, 56, 12, 12-2010, pàg. 1738–1745. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2010.07.002. PMID: 20637213.
  11. 11,0 11,1 11,2 11,3 Genetics, 148, 2, 2-1998, pàg. 815–25. DOI: 10.1093/genetics/148.2.815. PMC: 1459808. PMID: 9504927.