Usuari:Mcapdevila/Genoma de la leucèmia limfàtica crònica

El genoma de la leucèmia limfàtica crònica , de manera completa en 4 pacients, va ser seqüenciat per primera vegada l'any 2010 i publicat a la revista Nature el 5 de maig de 2011. ^[1] ^[2] La seqüenciació del genoma complet de la leucèmia limfàtica crònica permet conèixer els gens mutats-en relació amb els gens normals de cèl·lules no modificades que afecten els diferents malalts-, i establir quines són comuns o freqüents el que permetrà dissenyar tractaments específics per a cada pacient. ^[3]

La seqüenciació del genoma de la LLC ha estat duta a terme pel Projecte espanyol per a la seqüenciació del genoma de la LLC -amb la participació de més de 60 investigadors de diverses institucions investigadores i sanitàries-dirigits per Elías Campo i Carlos López Otín dins el Projecte Internacional del Genoma del Càncer (International Cancer Genome Consortium). ^[4] ^[5]

Projecte Internacional de Genoma del Càncer - ICGC

El Consorci Internacional del Genoma del Càncer (ICGC) és l'encarregat d'organitzar i coordinar un gran nombre de projectes de recerca que tenen l'objectiu comú d'aclarir exhaustivament els canvis genètics presents en molts dels càncers que afecten a persones en tothom.

L'objectiu principal és generar bases de dades globals de caràcter públic i obert accessibles a investigadors, metges i altres especialistes sobre les anomalies genòmiques (mutacions somàtiques, expressió anormal de gens, modificacions epigenètiques) en els tumors de 50 tipus diferents de càncer o subtipus de càncer que són de gran importància clínica i social arreu del món. Les dades es posaran a disposició de tota la comunitat investigadora amb la major rapidesa possible, i amb restriccions mínimes, per accelerar la investigació sobre les causes i el control del càncer. El ICGC pretén facilitar la comunicació entre els membres i proporciona un espai per a la coordinació amb l'objectiu de maximitzar l'eficiència entre els científics que treballen per entendre, tractar i prevenir aquestes malalties. ^[6]

Projecte genoma de la LLC (2009 - 2012)

Dins del projecte mundial per a la secuenciación del genoma del càncer gestionat pel Consorci Internacional del Genoma del Càncer (ICGC) Espanya és l'encarregada de la seqüència genòmica de la leucèmia limfàtica crònica ^[7] a través del Projecte genoma Leucèmia limfàtica crònica - Espanya . L'objectiu és seqüenciar el genoma en nombrosos pacients i poder establir les homogeneïtats, les variabilitats i, si s'escau, un diagnòstic més personalitzat i eficaç. ^[8] El 15 d'abril de 2010 van ser publicats a Nature els avenços dels primers resultats dels primers 5 genomes complets de pacients amb Els primers cinc genomes de leucèmia limfàtica crònica, El País, 2010.04.14] </ref> ^[9]

Organismes participants

L'organisme director i financer és el Institut de Salut Carles III (organisme públic dependent del Ministeri de Ciència i Innovació d'Espanya). ^[10] La direcció científica del projecte és a càrrec del Dr Elies Campo i del Dr Carlos López Otín. ^[11] ^[12] Dues de les institucions que participen i que tenen més tradició i reconeixement en LLC són el Hospital Clínic i Provincial de Barcelona i l'Hospital clínic de Salamanca. També participen la Universitat d'Oviedo, el Centre de Regulació Genòmica de Barcelona , l'Institut Català d'Oncologia, la Universitat de Deusto, el Centre Nacional d'Investigacions Oncològiques, el Banc Nacional d'ADN i la Universitat de Barcelona, amb el suport tècnic per a la investigació de la Xarxa Temàtica en Investigació Cooperativa en Càncer Investigadors espanyols comencen a seqüenciar el genoma de la leucèmia, HC] </ref>

Publicació Nature del genoma de la LLC el 5 juny 2011

El 5 de juny de 2011 va ser publicat a la revista Nature l'article-remès al desembre de 2010 - ^[13] fruit del treball de l'equip espanyol responsable del genoma de la LLC ^[7] i membre del International Cancer Genome Consortium. ^[1] ^[14]

Contingut de la publicació a Nature

En l'article Whole-genome sequencing identifies Recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia (seqüenciació completa del genoma de la leucèmia limfàtica crònica amb identificació de les mutacions recurrents) pot llegir-se: ^[1]

«

La leucèmia limfocítica crònica (LLC), la leucèmia més freqüent en adults en els països occidentals, és una malaltia heterogènia amb diagnòstic i evolució clínica variable. Es poden distingir dos subtipus moleculars principals, caracteritzats, respectivament, per un nombre alt o baix de hipermutaciones somàtiques a la regió variable dels gens implicats en la immunoglobulina. Els canvis moleculars que condueixen a la patogènesi de la malaltia són encara poc coneguts. La publicació presenta la realització de la seqüenciació del genoma complet de quatre casos de leucèmia limfàtica crònica (LLC o CLL) així com la identificació de 46 mutacions somàtiques que poden afectar la funció del gen. Una anàlisi més detallada d'aquestes mutacions en 363 pacients amb LLC ha identificat quatre gens que estan mutats de manera recurrent: notch 1 (NOTCH1), exportina 1 (XPO1), diferenciació mieloide del gen de resposta primària 88 (MyD88) i Kelch- like 6 (KLHL6). Les mutacions en MyD88 i KLHL6 predominen en els casos de LLC amb els gens d'immunoglobulina mutat, mentre que les mutacions NOTCH1 i XPO1 es van detectar principalment en pacients amb immunoglobulines sense mutació. Els patrons de mutació somàtica, amb el suport de les anàlisis funcionals i clínics, indiquen clarament que les mutacions recurrents NOTCH1, MyD88 i XPO1 són canvis oncogènics que contribueixen a l'evolució clínica de la malaltia. Fins on sabem, aquest és la primera anàlisi exhaustiva de la LLC que combina la seqüenciació del genoma complet de característiques clíniques i els resultats clínics. És destacable la utilitat d'aquest enfocament per a la identificació de mutacions clínicament rellevants en el càncer. ^[1]

»