Emberá-Wounaan és una comarca indígena de Panamà. Va ser creada en 1983 a partir de dos enclavaments situats en la Província de Darién, específicament dels districtes de Chepigana i Pinogana. La seva capital és Unión Chocó. La seva extensió és de 4383,5 km² i té una població de 9.269 habitants (2004), la majoria d'aquests pertanyen a les ètnies emberà i wounaans. La comarca es divideix en dos districtes i cinc corregimientos: